Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms