Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN13Q6MZZ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN13Q6MZZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms