Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms