Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A4Q6AI14 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms