Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT39Q6A163 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT39Q6A163 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms