Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms