Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms