Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZKSCAN2Q63HK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZKSCAN2Q63HK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN2Q63HK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms