Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms