Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MALRD1Q5VYJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms