Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHIC1Q5VXU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms