Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIPQ5VU43 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4DIPQ5VU43 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DIPQ5VU43 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DIPQ5VU43 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms