Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF20Q5VTR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF20Q5VTR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RNF20Q5VTR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RNF20Q5VTR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF20Q5VTR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF20Q5VTR2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms