Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PXDC1Q5TGL8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms