Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms