Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF14Q5SWL7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF14Q5SWL7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms