Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms