Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO47Q5MNV8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms