Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL4Q5MAI5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL4Q5MAI5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms