Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf38Q5JPI3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms