Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRB2Q5IJ48 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRB2Q5IJ48 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms