Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF542PQ5EBM4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF542PQ5EBM4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms