Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms