Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms