Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms