Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms