Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.7 ms