Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SBK1Q52WX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SBK1Q52WX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms