Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms