Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRY2Q49AN0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CRY2Q49AN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRY2Q49AN0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms