Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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