Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS9Q3SYG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms