Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSGA10IPQ3SY00 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSGA10IPQ3SY00 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSGA10IPQ3SY00 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSGA10IPQ3SY00 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms