Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HFEQ30201 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HFEQ30201 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HFEQ30201 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HFEQ30201 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HFEQ30201 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms