Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROSER3Q2NL68 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PROSER3Q2NL68 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROSER3Q2NL68 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms