Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SKIDA1Q1XH10 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms