Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF1Q17RB8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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