Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms