Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDO1Q16878 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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