Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPPQ16740 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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