Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LY6EQ16553 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LY6EQ16553 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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LY6EQ16553 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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LY6EQ16553 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LY6EQ16553 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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