Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF1Q15526 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SURF1Q15526 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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