Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms