Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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