Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABEP1Q15276 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABEP1Q15276 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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