Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPAQ15257 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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