Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXOSC7Q15024 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXOSC7Q15024 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms