Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GAPVD1Q14C86 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GAPVD1Q14C86 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms