Protein–RNA interactions for Protein: Q14657

LAGE3, EKC/KEOPS complex subunit LAGE3, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAGE3Q14657 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAGE3Q14657 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms