Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3AQ14563 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms